Grup kuraları Türkiye Futbol Federasyonunun Riva’daki merkezinde çekildi. Ziraat Türkiye Kupası grup aşamasındaki 32 takım, dörderli 8 grupta çift devreli lig usulüne göre mücadele edecek. Müsabakalar sonucunda gruplarında ilk 2 sırayı alan takımlar, son 16 turuna yükselecek.
Gruplarda ilk maçlar 29, 30 Kasım ve 1 Aralık’ta oynanacak. Kupada grup aşaması 19 Ocak 2017 tarihinde oynanacak maçlarla tamamlanacak. Kura çekiminin ardından Şanlıurfaspor A Grubunda yer aldı. Şanlıurfaspor’un rakipleri ise Kırklarelispor, Gaziantepspor ve Osmanlıspor oldu.